医院厕所的清洁程度，关系到就医环境和患者的健康。在加拿大，无论是公立还是私立医院对此都十分重视。
2008年，加拿大科学小组对全国医院厕所进行调查后发现，有1/3的医院厕所清洁不合规范。而且，一些医院的厕所，在打扫后看上去很干净，但实际检测后却发现，马桶坐垫、洗手池等地方还存在大量的传染病菌，很容易造成交叉感染。对此，加拿大许多大城市的医院已经开始行动起来。
医院厕所卫生清洁的关键要素是避免交叉感染。加拿大公立医院严格区分病人、医护人员和其他人员的厕所。公立医院的病房内都设有病人专用卫生间，而患者的亲属或其他人员则只能使用病房外的公共卫生间。至于医护人员，则有专用卫生间。有些医院还对厕所使用者进行区别，一些患有腹泻等疾病的人，要使用隔离出来的马桶，以减少传播病菌的可能，这在很大程度上避免了交叉感染。
在加拿大，医院实行全封闭式管理，无论病人、患者家属还是其他人，只有在大门口获得入内许可，领取一次性磁性纸条后才能入内。亲属不能陪床，医院内除了特许入内的少数人外，就只有病人和医护人员了。甚至除了急诊室，医院连门诊都不设，急诊室与其他部门会进行隔离，重症或疑难病症患者通常会直接推去抢救，不会在急诊室停留过久，最棘手的急诊室厕所交叉感染，也因此能得到很好地控制。这一方面有效地减少了厕所的使用率和交叉感染发生率，另一方面也改善了医院的卫生环境和秩序。
医院厕所还有专人定时进行打扫。清洁员都受过专业训练，他们知道哪些地方容易藏污纳垢，隐藏病菌，并且知道用什么方法可以彻底将其消除。厕所打扫实行“双签名”责任制，即在每间厕所里贴一张厕所清扫时间表，清扫人员每次清扫都要签名、填写时间，检察人员在复核无误后也会签名、填写时间，无论哪个环节出现问题，都会被严厉追究。清扫的间隔时间一般为1小时，不过也会根据医院性质的不同进行适当调整，通常会以张贴在卫生间内的清扫时间表为准。
医院卫生监督部门还会定期派专人，用特殊的检测仪器对医院厕所的卫生情况进行监督检查。这让患者的健康进一步得到了保障。而且，没有任何一家医院希望因厕所卫生问题，而让医院的名誉扫地，都会竭尽全力让医院厕所达到不只是“看上去很干净”。▲
